此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅rsamtools。
生物导体版本:3.10
该软件包提供了用于操纵SAM(序列对齐 / MAP),FASTA,二进制变体呼叫(BCF)和压缩索引索引索引Tab-Delimimited(TABIX)文件的“ Samtools”,“ BCFTools”和“ Tabix”实用程序的接口。
作者:马丁·摩根(Martin Morgan),赫尔夫(Herv)
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ rsamtools”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rsamtools”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ RSAMTOOLS”)
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视频 | 在rsamtools中堆积 |
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源包 | rsamtools_2.2.3.3.tar.gz |
Windows二进制 | rsamtools_2.2.3.3.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | rsamtools_2.2.2.3.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rsamtools |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rsamtools |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rsamtools/ |
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