此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见圣诞老人.
Bioconductor版本:3.10
该软件包提供了测量网络和表型之间的关联强度的方法。它通过测量整个网络(Knet)的表型聚类来做到这一点。顶点还可以根据它们与高权重顶点(Knode)的关联强度单独排名。
作者:Alex J. Cornish和Florian Markowetz
引文(从R内,输入引用(“圣诞老人”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SANTA")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“圣诞老人”)
超文本标记语言 | R脚本 | 圣诞老人简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,网络,NetworkEnrichment,软件 |
版本 | 2.24.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(7年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.14),igraph |
进口 | 矩阵,雪 |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,knitr,knitcitations,formatR,org.Sc.sgd.db,生命网络,DLBCL,二甲基砜 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | SANTA_2.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | SANTA_2.24.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | SANTA_2.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SANTA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SANTA |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SANTA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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