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SELEX
DOI:10.18129 / B9.bioc.SELEX
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SELEX。
分析SELEX-seq数据的功能
Bioconductor版本:3.10
基于SELEX-seq数据量化工具DNA结合特异性
作者:Chaitanya Rastogi Dahong刘,Harmen Bussemaker
维护人员:Harmen Bussemaker < hjb2004 columbia.edu >
从内部引用(R,回车引用(“公司”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“公司”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“公司”)
| R脚本 | 主题与SELEX-seq发现 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | GeneRegulation,MotifAnnotation,MotifDiscovery,软件,转录 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.7.0),rJava(0.5 > = 0),Biostrings(> = 2.26.0) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | Java (> = 1.5) |
| 增强了 | |
| URL | http://bussemakerlab.org/software/SELEX/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SELEX_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SELEX_1.18.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | SELEX_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SELEX |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SELEX |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SELEX/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
