SNPchip

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPchip

这个包是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.10版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见SNPchip．

拷贝号更改的可视化

Bioconductor版本:3.10

SNP阵列数据绘制函数;因历史原因而保留

作者:Robert Scharpf 和Ingo Ruczinski

维护者:Robert Scharpf

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“SNPchip”)

PDF	R脚本	绘制染色体组型
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，GeneticVariability，单核苷酸多态性，软件，可视化
版本	2.32.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (R-2.5)(13年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.14.0)
进口	方法、图形晶格、网格foreach跑龙套,Biobase，S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，SummarizedExperiment，oligoClasses(> = 1.31.1)
链接
建议	crlmm(> = 1.17.14),RUnit
SystemRequirements
增强了	doSNOW，VanillaICE(> = 1.21.24),RColorBrewer
URL	http://www.biostat.jhsph.edu/~iruczins/software/snpchip.html
取决于我	mBPCR
进口我	crlmm，phenoTest
建议我	MinimumDistance，oligoClasses，VanillaICE
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SNPchip_2.32.0.tar.gz
Windows二进制	SNPchip_2.32.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SNPchip_2.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SNPchip
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SNPchip
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SNPchip/
包下载报告	下载数据