SVAPLSseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.SVAPLSseq

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SVAPLSseq．

SVAPLSseq-An R包，用于估计不必要的可变性的隐藏因素，并根据它们进行调整，以实现基于RNAseq数据的更强大和更准确的差异表达式分析

Bioconductor版本:3.10

该包包含用于提取RNAseq数据中潜在变异特征的函数，并使用它们对两个特定生物组之间的一组特征(基因、转录本)进行改进的差异表达分析。

作者:Sutirtha Chakraborty

维护者:Sutirtha Chakraborty

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“SVAPLSseq”)

PDF	R脚本	SVAPLSseq教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，RNASeq，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor公司	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	方法、统计数据SummarizedExperiment，刨边机，ggplot2，limma，航空航天平行,请
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SVAPLSseq_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	SVAPLSseq_1.12.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SVAPLSseq_1.12.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SVAPLSseq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SVAPLSseq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SVAPLSseq/
软件包下载报告	下载数据