斯塔尔
doi：10.18129/b9.bioc.starr
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅斯塔尔。
Affymetrix芯片芯片数据的简单平铺阵列分析
生物导体版本：3.10
Starr促进了芯片芯片数据的分析，尤其是Affymetrix平铺阵列的数据。该软件包为数据导入，质量评估，数据可视化和探索提供了功能。此外，它还包括高级分析特征，例如芯片信号与带注释的特征的关联，芯片信号的相关分析和其他基因组数据（例如基因表达），使用CMARRT算法进行峰值调查以及比较芯片 - 芯片群的比较显示器。它使用基本的生物导体类表达组和probeanno，以最大程度地兼容生物导体上的其他软件。Starr的所有功能均可用于研究Ringo软件包中的预处理数据，反之亦然。一个重要的新颖工具是自动生成正确的，最新的微阵列探针注释（BPMAP）文件，该文件依赖于对短序列（例如，微阵列上的探针序列）的有效映射到任意基因组。
作者：Benedikt Zacher，Johannes Soeding，Pei Fen Kuan，Matthias Siebert，Achim Tresch
维护者：benedikt Zacher
引用（从r内，输入引用（“ Starr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ starr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Starr”）
| R脚本 | 简单的平铺阵列分析 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 芯片，，，，DataImport，，，，微阵列，，，，Onechannel，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，软件 |
| 版本 | 1.42.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.5（R-2.10）（10。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 林戈，，，，副词，，，，affxparser |
| 进口 | pspline，，，，大量的，，，，Zlibbioc |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 核 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | starr_1.42.0.tar.gz |
| Windows二进制 | starr_1.42.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | starr_1.42.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/starr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/starr |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/starr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
