tfea.chip

doi:10.18129/b9.bioc.tfea.chip

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅tfea.chip

分析转录因子富集

生物导体版本:3.10

使用CHIP-Seq实验的数据在基因集中分析转录因子富集的包装。

作者:Laura PuenteSantamaría,Luis del Peso

维护者:laura puentesantamaría

引用(从r内,输入引用(“ tfea.chip”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tfea.chip”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ tfea.chip”)

html R脚本 TFEA.CHIP:用于转录因子富集的工具套件
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,结肠管制,,,,基因烯,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(2年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.3)
进口 基因组机,,,,iranges,,,,Biomart,,,,GenomicFeatures,grdevices,dplyr,统计,utils,r.utils, 方法,org.hs.eg.db
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,S4VECTORS,,,,情节,,,,,,,,花花公子,,,,GGPLOT2,,,,gseabase,,,,deseq2,,,,生物基因,,,,Ggrepel,,,,rcompanion,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tfea.chip_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 tfea.chip_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) tfea.chip_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tfea.chip
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tfea.chip
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/tfea.chip/
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