TargetScore

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetScore

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见TargetScore．

TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标

Bioconductor版本:3.10

通过概率建模microRNA过表达折叠变化的可能性和序列评分推断microRNA靶标的后验分布。采用变向贝叶斯-高斯混合模型(VB-GMM)记录折叠变化和序列得分，得到潜在变量作为miRNA靶标的后位。最终的targetScore计算为sigmoid转换的折叠变化，由目标组件在所有特征上的平均后置加权。

作者:李岳

维护者:Yue Li

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“TargetScore”)

PDF	R脚本	TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标
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文本		新闻

细节

biocViews	软件，microrna的
版本	1.24.0
在Bioconductor公司	BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证	GPL-2
取决于	pracma，矩阵
进口
链接
建议	TargetScoreData，gplots，Biobase，GEOquery
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html
全靠我
进口我
建议我	TargetScoreData
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	TargetScore_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	TargetScore_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	TargetScore_1.24.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/TargetScore
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TargetScore
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TargetScore/
软件包下载报告	下载数据