香草

doi:10.18129/b9.bioc.vanillaice

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅香草

高通量基因分型阵列的隐藏马尔可夫模型

生物导体版本:3.10

隐藏的马尔可夫模型,用于表征高吞吐量SNP阵列中的染色体改变。

作者:jhu.edu>,Kevin Scharpf和Ingo Ruczinski

维护者:jhsph.edu>的Robert Scharpf

引用(从r内,输入引用(“香草”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ vanillaice”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Vanillaice”)

PDF R脚本 crlmmdownstream
PDF R脚本 Vanillaice Vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,软件
版本 1.48.0
在生物导体中 Bioc 2.1(R-2.6)(12。5年)
执照 LGPL-2
要看 r(> = 3.5.0),生物基因(> = 0.13.6),基因组机(> = 1.27.6),总结性特征(> = 1.5.3)
进口 生物酶,,,,S4VECTORS(> = 0.23.18),iranges(> = 1.14.0),寡群(> = 1.31.1),foreach,,,,矩阵,,,,Data.Table, 网格,格子, 方法,GenomeInfodB(> = 1.11.4),crlmm,工具,统计,utils,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18
链接
建议 运行,,,,Snpchip,,,,Human610Quadv1bcrlmm,,,,arraytv
系统要求
增强 DOMC,,,,DOMPI,,,,Dosnow,,,,多帕尔,,,,多里迪斯
URL
取决于我 最小值
进口我
建议我 寡群
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Vanillaice_1.48.0.tar.gz
Windows二进制 Vanillaice_1.48.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Vanillaice_1.48.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vanillaice
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/香草
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/vanillaice/
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