此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅香草。
生物导体版本:3.10
隐藏的马尔可夫模型,用于表征高吞吐量SNP阵列中的染色体改变。
作者:jhu.edu>,Kevin Scharpf和Ingo Ruczinski
维护者:jhsph.edu>的Robert Scharpf
引用(从r内,输入引用(“香草”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ vanillaice”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Vanillaice”)
R脚本 | crlmmdownstream | |
R脚本 | Vanillaice Vignette | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 库务,,,,软件 |
版本 | 1.48.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.1(R-2.6)(12。5年) |
执照 | LGPL-2 |
要看 | r(> = 3.5.0),生物基因(> = 0.13.6),基因组机(> = 1.27.6),总结性特征(> = 1.5.3) |
进口 | 生物酶,,,,S4VECTORS(> = 0.23.18),iranges(> = 1.14.0),寡群(> = 1.31.1),foreach,,,,矩阵,,,,Data.Table, 网格,格子, 方法,GenomeInfodB(> = 1.11.4),crlmm,工具,统计,utils,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18 |
链接 | |
建议 | 运行,,,,Snpchip,,,,Human610Quadv1bcrlmm,,,,arraytv |
系统要求 | |
增强 | DOMC,,,,DOMPI,,,,Dosnow,,,,多帕尔,,,,多里迪斯 |
URL | |
取决于我 | 最小值 |
进口我 | |
建议我 | 寡群 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Vanillaice_1.48.0.tar.gz |
Windows二进制 | Vanillaice_1.48.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Vanillaice_1.48.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vanillaice |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/香草 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/vanillaice/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |