此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affycoretools.
Bioconductor版本:3.10
编写了各种包装器函数,以简化核心生物统计学家可能看到的更常见的分析。
作者:詹姆斯·w·麦克唐纳
维护者:James W. MacDonald
引文(从R内,输入引用(“affycoretools”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("affycoretools")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“affycoretools”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用\Biocpkg{affycoretools}和ReportingTools创建带注释的输出 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,微阵列,OneChannel,ReportWriting,软件 |
版本 | 1.58.4 |
在Bioconductor | BioC 1.8 (R-2.3)(14年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase、方法 |
进口 | affy,limma,GOstats,gcrma样条函数,xtable,AnnotationDbi,ggplot2,gplots,oligoClasses,ReportingTools,hwriter,晶格,S4Vectors,刨边机,RSQLite,BiocGenerics,DBI,Glimma |
链接 | |
建议 | affydata,hgfocuscdf,BiocStyle,knitr,hgu95av2.db,rgl,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | AgiMicroRna |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | affycoretools_1.58.4.tar.gz |
Windows二进制 | affycoretools_1.58.4.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | affycoretools_1.58.4.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affycoretools |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affycoretools |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/affycoretools/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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