高山

DOI:10.18129 / B9.bioc.alpine

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见高山．

高山

Bioconductor版本:3.10

片段序列偏差建模和校正RNA-seq转录物丰度估计。

作者:Michael Love, Rafael Irizarry

维护者:Michael Love

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("alpine")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“高山”)

超文本标记语言	R脚本	高山
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，BatchEffect，报道，DifferentialSplicing，GeneExpression，归一化，质量控制，RNASeq，测序，软件，转录，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor中	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.3)
进口	Biostrings，IRanges，GenomicRanges，GenomicAlignments，Rsamtools，SummarizedExperiment，GenomicFeatures，speedglm样条函数,图，RBGL，stringr、统计、方法、图形、GenomeInfoDb，S4Vectors
链接
建议	knitr，testthat，alpineData，rtracklayer，ensembldb，BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38，RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	alpine_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	alpine_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	alpine_1.12.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/alpine
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/alpine/
软件包下载报告	下载数据