anota2seq
doi：10.18129/b9.bioc.anota2seq
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅anota2seq。
通常使用Anota2Seq对翻译效率的全转录组分析通常适用
生物导体版本：3.10
ANOTA2SEQ提供了通过RNA测序或DNA-微阵列量化的多聚糖促进和核糖体促进研究（两个或多个样本类）的翻译效率和差异表达分析。多核体和核糖体促进通常会生成两个RNA源的数据；翻译mRNA和总mRNA。差异表达的分析用于估计每个RNA源内的变化（即翻译的mRNA或总mRNA）。转化效率的分析旨在确定转化效率的变化，导致蛋白质水平改变，这些蛋白质水平与总mRNA水平无关（即转化的mRNA的变化，与总mRNA的水平无关）或缓冲，这是一种调节转化效率的机制，以便蛋白质水平尽管总mRNA水平波动，但仍保持恒定（即，与翻译mRNA水平无关的总mRNA变化）。ANOTA2SEQ应用了部分方差和随机方差模型的分析来完成这些任务。
作者：克里斯蒂安·奥尔特林
维护者：克里斯蒂安·奥尔特林（Christian Oertlin
引用（从r内，输入引用（“ anota2seq”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ anota2seq”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ anota2seq”）
| R脚本 | 通常使用Anota2Seq对翻译效率的全转录组分析通常适用 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 批处理效应，，，，差异性，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，Genomewideassociation，，，，免疫学，，，，微阵列，，，，正常化，，，，rnaseq，，，，回归，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.4.0），方法 |
| 进口 | 多检验，，，，QVALUE，，，，林玛，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，rcolorbrewer，grdevices，图形，统计，utils，总结性特征 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | anota2Seq_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | anota2Seq_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | anota2Seq_1.8.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/anota2seq |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/anota2seq |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/anota2seq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
