后面;

DOI:10.18129 / B9.bioc.batchelor

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见后面;。

单细胞批量校正方法

Bioconductor版本:3.10

实现了单细胞(RNA测序)数据批量校正的多种方法。这包括基于检测相互最近邻居的方法，以及对数表达式值线性回归的几种有效变体。还提供了一些函数来执行全局重新缩放以消除批次之间的深度差异，并执行主成分分析，该分析对批次之间细胞数量的差异具有鲁棒性。

作者:Aaron Lun [aut, cre]， Laleh Haghverdi [ctb]

维护者:Aaron Lun

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("batchelor")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“确定”)

超文本标记语言	R脚本	1.修正批处理效果
超文本标记语言	R脚本	2.扩展方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，GeneExpression，归一化，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组
版本	1.2.4
在Bioconductor中	BioC 3.9 (R-3.6)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	SingleCellExperiment
进口	SummarizedExperiment，S4Vectors，BiocGenerics，Rcpp，统计，方法，utils，BiocNeighbors，BiocSingular，矩阵，DelayedArray，DelayedMatrixStats，嘘，BiocParallel
链接	Rcpp，beachmat
建议	testthat，BiocStyle，knitr，beachmat，食物，scRNAseq
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	batchelor_1.2.4.tar.gz
Windows二进制	batchelor_1.2.4.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	batchelor_1.2.4.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/batchelor
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/batchelor
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/batchelor/
软件包下载报告	下载数据