Biosvd.

DOI：10.18129 / b9.bioc.biosvd.

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Biosvd.。

用于高吞吐量数据处理，异常值检测，噪声去除和动态建模包装

生物导体版本：3.10

BIOSVD封装包含用于将从特征x测定空间中的输入数据减少到降低的对角化特征X特征和测定的特征和特征叠加的特征x测定空间。随后可以基于所产生的图表检查施加到数据的SVD的结果，例如特征性X测定基质的热图和具有所有特征特征的特征表达级分的条形图。这些图表有助于确定要滤除哪个特征和特征大作用（即，代表稳态，噪声或实验伪影的特征小阶段;或者在应用于数据的方差时，表现出稳定尺度方差的特征特征）。在可能移除稳态表达式，稳定方差，噪声和实验伪影之后，并在将SVD重新应用于归一化数据之后，生成了EIGENSYSTEM的摘要HTML报告，其中包含了分析和特征的其他极性图，根据其坐标，半径和相位在极性图中的坐标，半径和相位可视化，根据两个选定的特征/测定注释信息进行排序的数据的可视化。这给出了表达/强度水平的动态的全球图像，其中单独的特征和测定分类为类似的调节和功能或类似细胞状态和生物学表型。

作者：AnneleN Daemen ，Matthew Brauer

维护者：AnneleN Daemen ，Matthew Brauer

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“biosvd”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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PDF.	r script.	Biosvd.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	软件那时间课程那可视化
版本	2.22.0
在生物导体中以来	BIOC 2.14（R-3.1）（6年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.1.0）
进口	生物根系那BioBase.，方法，网格，图形，NMF.
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	biosvd_2.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件	biosvd_2.22.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	biosvd_2.22.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/biosvd.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ biosvd
包短网址	https://biocumon.org/packages/biosvd/
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