此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅CBAF。
生物导体版本:3.10
该软件包包含允许分析和比较来自不同癌症/癌症亚组的各种基因组的功能。到目前为止,它与存储在cbioportal.org上的RNA-seq,microRNA-Seq,微阵列和甲基化数据集兼容。
作者:Arman Shahrisa [AUT,CRE,CPH],Maryam Tahmasebi Birgani [aut]
维护者:Arman Shahrisa
引用(从r内,输入引用(“ CBAF”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cbaf”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CBAF”)
html | R脚本 | CBAF |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 测定域,,,,生物医学信息学,,,,比较基因组学,,,,DNAMETHYLATY,,,,表观遗传学,,,,基因表达,,,,遗传学,,,,研究菲尔德,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学 |
版本 | 1.8.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(2。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | |
进口 | Biocfilecache,,,,rcolorbrewer,,,,CGDSR,,,,GeneFilter,,,,GPLOTS,grdevices,统计,utils,xlsx |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cbaf_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | cbaf_1.8.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | cbaf_1.8.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cbaf |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cbaf/ |
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