cn.farms

DOI:10.18129 / B9.bioc.cn.farms

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见cn.farms

cn。农场-因子分析拷贝数估计

Bioconductor版本:3.10

这个包实现了cn。拷贝数变异(CNV)分析的FARMS算法。cn。FARMS允许分析最常见的Affymetrix (250K-SNP6.0)阵列类型,支持使用snow和ff进行高性能计算。

作者:Andreas Mitterecker, Djork-Arne Clevert

维护者:Andreas Mitterecker < Mitterecker at bioinf.jku.at>

引文(从R内,输入引用(“cn.farms”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cn.farms”)

PDF R脚本 cn.farms: Manual for the R package
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation微阵列软件
版本 1.34.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(9年)
许可证 LGPL (>= 2.0)
取决于 R (>= 3.0),Biobase、方法、ffoligoClasses
进口 DBIaffxparser益生元DNAcopypreprocessCore晶格
链接
建议 pd.mapping250k.stypd.mapping250k.nsppd.genomewidesnp.5pd.genomewidesnp.6
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 cn.farms_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 cn.farms_1.34.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) cn.farms_1.34.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cn.farms
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cn.farms
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/cn.farms/
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