Coseq

doi:10.18129/b9.bioc.coseq

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Coseq

测序数据的共表达分析

生物导体版本:3.10

高通量测序数据引起的表达曲线的共表达分析。使用适应性转换和混合模型或K均值算法聚类(例如,基因)曲线,并提供了模型选择标准(选择适当数量的簇)。

作者:Andrea Rau,Cathy Maugis-Rabusseau,Antoine Godichon-Baggioni

维护者:Andrea rau

引用(从r内,输入引用(“ Coseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ coseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ coseq”)

html R脚本 Coseq
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(3年)
执照 GPL(> = 3)
要看 r(> = 3.4.0),总结性特征,,,,S4VECTORS
进口 EDGER,,,,deseq2,,,,Capushe,,,,rmixmod,,,,E1071,,,,生物比较,,,,GGPLOT2(> = 2.1.0),,,,,htsfilter,,,,Corrplot,,,,htscluster(> = 2.0.8),grdevices,图形,统计,方法,组成,,,,mvtnorm
链接
建议 生物酶,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 coseq_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 coseq_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) coseq_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/coseq
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/coseq/
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