此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Coseq。
生物导体版本:3.10
高通量测序数据引起的表达曲线的共表达分析。使用适应性转换和混合模型或K均值算法聚类(例如,基因)曲线,并提供了模型选择标准(选择适当数量的簇)。
作者:Andrea Rau,Cathy Maugis-Rabusseau,Antoine Godichon-Baggioni
维护者:Andrea rau
引用(从r内,输入引用(“ Coseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ coseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ coseq”)
html | R脚本 | Coseq |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(3年) |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | r(> = 3.4.0),总结性特征,,,,S4VECTORS |
进口 | EDGER,,,,deseq2,,,,Capushe,,,,rmixmod,,,,E1071,,,,生物比较,,,,GGPLOT2(> = 2.1.0),秤,,,,htsfilter,,,,Corrplot,,,,htscluster(> = 2.0.8),grdevices,图形,统计,方法,组成,,,,mvtnorm |
链接 | |
建议 | 生物酶,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | coseq_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | coseq_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | coseq_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/coseq |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/coseq/ |
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