crisprseekplus

DOI:10.18129 / B9.bioc.crisprseekplus

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见crisprseekplus

crisprseekplus

Bioconductor版本:3.10

生物信息学平台,包含与CRISPRseek包中的offTargetAnalysis和compare2Sequences工作的接口,以及GUIDEseqAnalysis。

作者:Sophie Wigmore , Alper Kucukural < Alper。Kucukural在umassmed。edu>,Lihua Julie Zhu , Michael Brodsky , Manuel Garber

维护者:Alper Kucukural < Alper。Kucukural在umassmed。edu>

引文(从R内,输入引用(“crisprseekplus”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("crisprseekplus")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“crisprseekplus”)

超文本标记语言 R脚本 DEBrowser装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews GeneRegulationSequenceMatching软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证 GPL-3 +文件许可证
取决于 R (>= 3.3.0),闪亮的shinyjsCRISPRseek
进口 DT跑龙套,GUIDEseqGenomicRangesGenomicFeaturesBiocManagerBSgenomeAnnotationDbi哈希
链接
建议 testthatrmarkdownknitrR.rsp
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/UMMS-Biocore/crisprseekplus
BugReports https://github.com/UMMS-Biocore/crisprseekplus/issues/new
全靠我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 crisprseekplus_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 crisprseekplus_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) crisprseekplus_1.12.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crisprseekplus
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/crisprseekplus
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/crisprseekplus/
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