此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见crisprseekplus.
Bioconductor版本:3.10
生物信息学平台,包含与CRISPRseek包中的offTargetAnalysis和compare2Sequences工作的接口,以及GUIDEseqAnalysis。
作者:Sophie Wigmore
维护者:Alper Kucukural < Alper。Kucukural在umassmed。edu>
引文(从R内,输入引用(“crisprseekplus”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("crisprseekplus")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“crisprseekplus”)
超文本标记语言 | R脚本 | DEBrowser装饰图案 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | GeneRegulation,SequenceMatching,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年) |
许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.3.0),闪亮的,shinyjs,CRISPRseek |
进口 | DT跑龙套,GUIDEseq,GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocManager,BSgenome,AnnotationDbi,哈希 |
链接 | |
建议 | testthat,rmarkdown,knitr,R.rsp |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/UMMS-Biocore/crisprseekplus |
BugReports | https://github.com/UMMS-Biocore/crisprseekplus/issues/new |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | crisprseekplus_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | crisprseekplus_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | crisprseekplus_1.12.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crisprseekplus |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/crisprseekplus |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/crisprseekplus/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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