crlmm
doi：10.18129/b9.bioc.crlmm
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅crlmm。
Affymetrix SNP 5.0和6.0和Illumina阵列的基因型调用（CRLMM）和副本编号分析工具
生物导体版本：3.10
更快地实现了针对SNP 5.0和6.0阵列的CRLMM，以及针对5.0、6.0和Illumina平台的复制号工具。
作者：Benilton S Carvalho，Robert Scharpf，Matt Ritchie，Ingo Ruczinski，Rafael A Irizarry
维护者：benilton s carvalho
引用（从r内，输入引用（“ crlmm”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ crlmm”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ crlmm”）
| 拷贝数估计 | ||
| CRLMM小插图 - 下游分析 | ||
| R脚本 | CRLMM小插图 - 基因分型 | |
| 用于副本编号分析的基础架构 | ||
| 复制号码vignettes的概述 | ||
| 用于副本编号分析的预处理和基因分型阵列 | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，微阵列，，，，预处理，，，，SNP，，，，软件 |
| 版本 | 1.44.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.4（R-2.9）（11年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 2.14.0），寡群（> = 1.21.12），预处理（> = 1.17.7） |
| 进口 | 方法，生物酶（> = 2.15.4），生物基因，，，，affyio（> = 1.23.2），Illuminaio，，，，椭圆，，，，mvtnorm，花键，统计，Snpchip，utils，格子，，，，ff，，，，foreach，，，，rcppeigen（> = 0.3.1.2.1），矩阵，，，，VGAM，并行，图形，林玛，，，，beanplot |
| 链接 | 预处理（> = 1.17.7） |
| 建议 | hapmapsnp6，，，，Genomewidenp6crlmm（> = 1.0.7），ggdata，，，，snpstats，，，，运行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 香草 |
| 建议我 | arraytv，，，，hapmap370k，，，，寡群，，，，Snpchip |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | crlmm_1.44.0.tar.gz |
| Windows二进制 | crlmm_1.44.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | crlmm_1.44.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crlmm |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/crlmm |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/crlmm/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
