此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅腹带。
生物导体版本:3.10
允许持续存储,访问,探索和操纵袖扣高通量测序数据。此外,为常用可视化提供了许多绘图功能。
作者:L。Goff,C。Trapnell,D。Kelley
维护者:忠诚的A. Goff
引用(从r内,输入引用(“康姆斯邦”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cummerbund”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Cummerbund”)
R脚本 | Cummerbund用户指南 | |
R脚本 | 样本Cummerbund工作流程 | |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物信息学,,,,聚类,,,,DataImport,,,,datarepresentation,,,,差异性,,,,基因表达,,,,高通量序列,,,,高通量序列数据,,,,基础设施,,,,多蛋白酶,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,rnaseqdata,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 2.28.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.9(R-2.14)(8。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.7.0),生物基因(> = 0.3.2),rsqlite,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2,,,,快速积分,,,,rtracklayer,,,,GVIZ |
进口 | 方法,plyr,,,,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),生物酶 |
链接 | |
建议 | 簇,,,,plyr,,,,NMFN,,,,Stringr,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,rjson |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | MESHR |
建议我 | 同工型间分析仪 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cummerbund_2.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | cummerbund_2.28.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | cummerbund_2.28.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cummerbund |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/康姆犬 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cummerbund/ |
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