cydar

DOI:10.18129 / B9.bioc.cydar

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见cydar．

使用质量细胞术进行差异丰度分析

Bioconductor版本:3.10

在大量细胞计数数据中识别样品和组之间差异丰富的群体。提供了超球细胞计数、控制空间错误发现率和可视化高维标记空间中丰度变化的方法。

作者:Aaron Lun [aut, cre]

维护者:Aaron Lun

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cydar")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“cydar”)

超文本标记语言	R脚本	在细胞计数数据中检测差异丰富的亚群
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	FlowCytometry，ImmunoOncology，MultipleComparison，蛋白质组学，SingleCell，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor中	BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	BiocParallel，SingleCellExperiment
进口	冬青、方法、闪亮的、图形、统计、grDevices、utils、BiocGenerics，S4Vectors，flowCore，Biobase，Rcpp，BiocNeighbors，SummarizedExperiment
链接	Rcpp
建议	ncdfFlow，testthat，knitr，刨边机，limma，glmnet，BiocStyle，flowStats
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	cydar_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	cydar_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	cydar_1.10.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cydar
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cydar
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cydar/
软件包下载报告	下载数据