此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅ddpcrclust。
生物导体版本:3.10
DDPCRCLUST算法可以自动量化具有多达四个目标的非正交DDPCR反应的CPD。为了确定每个目标的正确液滴计数,至关重要的是识别所有簇并根据其位置正确标记它们。有关可以分析哪些数据以及如何格式化模板的更多信息,请检查小插图。
作者:Benedikt G. Brink [AUT,CRE],Justin Meskas [CTB],Ryan R. Brinkman [CTB]
维护者:benedikt G. Brink
引用(从r内,输入引用(“ ddpcrclust”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ddpcrclust”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ddpcrclust”)
R脚本 | 生物导体乳胶样式 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 聚类,,,,软件,,,,DDPCR |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(2年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.5) |
进口 | plotrix,,,,线索, 平行,GGPLOT2,,,,OpenXLSX,,,,r.utils,,,,流核,,,,流量密度(> = 1.13.3),Samspectral,,,,flowpeaks |
链接 | |
建议 | 生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/bgbrink/ddpcrclust |
BugReports | https://github.com/bgbrink/ddpcrclust/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ddpcrclust_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | ddpcrclust_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ddpcrclust_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ddpcrclust |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ddpcrclust |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ddpcrclust/ |
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