epivizrchart

doi:10.18129/b9.bioc.pepivizrchart

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅epivizrchart

R接口到Epiviz Web组件

生物导体版本:3.10

该软件包提供了使用Epiviz Web组件对基因组数据进行交互式可视化的API。R/Bioconductor中的对象可用于生成交互式R Markdown/Notebook文档,也可以在R Studio的默认查看器中可视化。

作者:Brian Gottfried [AUT],Jayaram Kancherla [AUT],Hector Corrada Bravo [AUT,CRE]

维护者:hector Corrada bravo

引用(从r内,输入引用(“ epivizrchart”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ epivizrchart”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ epivizrchart”)

html R脚本 Epivizrchart简介
html R脚本 使用Epivizrchart可视化`rangesummarizedExperiment`对象闪亮的应用程序
html R脚本 用epivizrchart可视化文件
html R脚本 使用EpivizRchart可视化闪亮应用中的基因组数据
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 GUI,,,,软件,,,,可视化
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.4.0)
进口 epivizrdata(> = 1.5.1),Epivizrserver,,,,htmltools,,,,rjson, 方法,生物基因
链接
建议 测试,,,,roxygen2,,,,尼特,,,,生物酶,,,,基因组机,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,总结性特征,,,,抗fofilesdata,,,,hgu133plus2.db,,,,mus.musculus,,,,生物使用,,,,同性恋,,,,闪亮的,,,,Minfi,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,rcolorbrewer,,,,马格里特,,,,AnnotationHub
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 epivizrchart_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 epivizrchart_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) epivizrchart_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrchart
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/epivizrchart
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/epivizrchart/
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