Eudysbiome

doi:10.18129/b9.bioc.eudysbiome

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Eudysbiome

16S微生物数据上的笛卡尔图和应急测试

生物导体版本:3.10

eudysbiome允许根据其对宿主疾病的能力(如文献中所示)或根据其模棱两可的属分类来促进宿主疾病的能力(如文献中所示),以鉴定差异属作为有害/无害。此外,该包装从统计学上测量了给定治疗或环境变化对(肠内 - 肠,GI)微生物组的食性(无害属增加或有害属的属或有害的属减少)或失调(无害属属或有害的属增加)的影响参考条件的微生物组。

作者:Xiaoyuan Zhou,Christine Nardini

维护者:Xiaoyuan Zhou

引用(从r内,输入引用(“ Eudysbiome”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ eudysbiome”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Eudysbiome”)

PDF R脚本 Eudysbiome用户手册
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(4。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.1.0)
进口 plyr,,,,rsamtools,,,,r.utils,,,,生物弦
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 eudysbiome_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 eudysbiome_1.16.0.zip(仅64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) eudysbiome_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eudysbiome
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/eudysbiome
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/eudysbiome/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户