fcscan

doi:10.18129/b9.bioc.fcscan

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅fcscan

FCSCAN用于检测使用用户定义选项的坐标簇

生物导体版本:3.10

该软件包用于检测属于用户定义的窗口大小内的基因组坐标的组合以及所确定的相邻簇之间的用户定义重叠。它可用于基因组数据,其中簇构建在特定的染色体或特定链上。可以使用“贪婪”选项执行聚类,从而允许在允许的窗口大小中存在其他站点。

作者:abdallah el-kurdi ghiwa khalil georges khazen pierre khoueiry lb> lb>

维护者:aub.edu.lb> abdallah el-kurdi

引用(从r内,输入引用(“ FCSCAN”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ fcscan”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ FCSCAN”)

html R脚本 fcscan
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 聚类,,,,基因数,,,,软件
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(<6个月)
执照 艺术2.0
要看
进口 统计,plyr,,,,变体,,,,总结性特征,,,,rtracklayer,,,,基因组机, 方法,iranges
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 fcscan_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制 fcscan_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) fcscan_1.0.0.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fcscan
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/fcscan
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/fcscan/
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