flowSpy

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowSpy

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见flowSpy．

流式和大规模细胞术数据工具箱

Bioconductor版本:3.10

用于流式和大规模细胞术数据的轨迹推断和可视化工具包。flowSpy提供完整的流式和流式细胞仪数据分析工作流。flowSpy可以是一个有价值的工具，应用范围从聚类和降维到轨迹重建和伪时间估计的流动和大规模细胞术数据。

作者:戴玉婷[aut, cre]

维护者:戴玉婷

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("flowSpy")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“flowSpy”)

超文本标记语言	R脚本	Quick_start
PDF		Quick_start_of_flowSpy.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，CellBiology，聚类，FlowCytometry，网络，NetworkInference，软件，可视化
版本	1.0.4
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6)，igraph
进口	FlowSOM，Rtsne，ggplot2，命运，gmodels，flowUtils，Biobase，矩阵，flowCore，股东价值分析，matrixStats、方法、mclust，prettydoc，RANN(> = 2.5),Rcpp(> = 0.12.0),BiocNeighbors，集群，pheatmap，scatterpie，umap，scatterplot3d，limma，stringr， grDevices, grid, stats
链接	Rcpp
建议	BiocGenerics，knitr，RColorBrewer，rmarkdown，testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.r-project.orghttps://github.com/JhuangLab/flowSpy
BugReports	https://github.com/JhuangLab/flowSpy/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	flowSpy_1.0.4.tar.gz
Windows二进制	flowSpy_1.0.4.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	flowSpy_1.0.4.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowSpy
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowSpy
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/flowSpy/
软件包下载报告	下载数据