flowWorkspace

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowWorkspace

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见flowWorkspace

用于表示和交互门控和非门控细胞术数据集的基础设施。

Bioconductor版本:3.10

这个包的设计是为了方便在flowJo中对自动门控方法和手动门控方法进行比较。这个包允许您将基本的flowJo工作区导入到BioConductor中,并使用flowCore功能从flowJo复制门控。执行门控层次结构、样本组、补偿和转换,以便输出与flowJo分析相匹配。

作者:Greg Finak, Mike Jiang

维护者:Greg Finak ,Mike Jiang

引用(来自R,输入引用(“flowWorkspace”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("flowWorkspace")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“flowWorkspace”)

超文本标记语言 R脚本 一个用于存储和操作门控流数据的包
超文本标记语言 R脚本 如何合并GatingSets
超文本标记语言 R脚本 如何绘制门控数据
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 安装

细节

biocViews DataImportDataRepresentationFlowCytometryImmunoOncology预处理软件
版本 3.34.1
在Bioconductor中 BioC 2.9 (R-2.14)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 BiobaseBiocGenerics、图形、grDevices、晶格、methods、stats、stats4、utils、RBGL、工具、gridExtraRgraphvizdata.tabledplyrlatticeExtraRcppRColorBrewerstringr尺度flowVizmatrixStats消化RcppParallelflowCore(> = 1.51.4),ncdfFlow(> = 2.31.1)
链接 Rcpp黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLib(> = 1.7.1上),cytolib(> = 1.7.4),RcppParallel
建议 testthatflowWorkspaceDataknitrggcyto平行,CytoMLopenCyto
SystemRequirements GNU make, c++ 11
增强了
URL
这取决于我 ggcytohighthroughputassays限定符
进口我 CytoMLflowDensityFlowSOMflowStatsImmuneSpaceRopenCyto限定符
建议我 指南针flowClustflowCore
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 flowWorkspace_3.34.1.tar.gz
Windows二进制 flowWorkspace_3.34.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) flowWorkspace_3.34.1.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/flowWorkspace
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/flowWorkspace
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/flowWorkspace/
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