genefilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefilter

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见genefilter

基因过滤器:从高通量实验中过滤基因的方法

Bioconductor版本:3.10

筛选基因的一些基本功能。

作者:R. Gentleman, V. Carey, W. Huber, F. Hahne

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“genefilter”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“genefilter”)

PDF R脚本 附加图:独立过滤增加了检测差异表达基因的能力,Bourgon等人,PNAS (2010)
PDF R脚本 独立滤波诊断
PDF R脚本 如何找到与特定基因表达谱相似的基因
PDF R脚本 使用基因过滤器功能从微阵列数据集中过滤基因
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列软件
版本 1.68.0
在Bioconductor公司 BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 15年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 BiocGenerics(> = 0.31.2),AnnotationDbi注释Biobase,图形,方法,统计,生存
链接
建议 hgu95av2.dbtkWidgets所有中华民国DESeqpasillaRColorBrewerBiocStyleknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 a4BasecellHTS2CNToolsFlowSorted.Blood.EPICGeneMetaHiiragi2013maEndToEndrnaseqGenesimpleaffySISPA股东价值分析
进口我 affyQCReport阿尔卑斯山脉annmaparrayQualityMetrics类别cbafcountsimQCcovRNADESeqDESeq2DEXSeqeisaENmixgCMAPGGBaseGISPAGSRIIHWpaperJunctionSeqmethyAnalysismethylCCmethylumiminfiMLInterfacesmogsaNBAMSeqpcaExplorerPECAphenoTestpwrEWAS林格RNAinteractMAPKsimpleaffyTCGAbiolinkstilingArrayXDEzinbwave
建议我 AffyExpress注释ArrayToolsBiocCaseStudies生命网络BloodCancerMultiOmics2017categoryCompareClassifyRclusterStabcodelink可乐compcodeRcuratedBladderDatacuratedCRCDatacuratedOvarianDataDelayedArrayEnrichedHeatmapfactDesignffpeffpeExampleDatagageDataGenoGAMGenomicFilesGOstatsGSARGSEAlmGSVAlogicFS光民MAQCsubsetMCRestimateMMUPHinnpGSEA益生元phyloseqpvacqpgraphRforProteomicsrheumaticConditionWOLLBOLDrtracklayersiggenesSingle.mTEC.TranscriptomesSSPAtopGO
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 genefilter_1.68.0.tar.gz
Windows二进制 genefilter_1.68.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) genefilter_1.68.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/genefilter
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/genefilter/
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