genefu

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefu

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genefu。

计算在乳腺癌的基因表达式的签名

Bioconductor版本:3.10

描述:这个包包含函数执行各种任务通常需要通过基因表达分析,特别是在乳腺癌研究:基因不同的微阵列平台之间的映射,分子亚型的识别,实现出版基因签名,基因选择、和生存分析。

作者:蒂娜硕士Gendoo, Natchar Ratanasirigulchai,马库斯·s·施罗德拉娅削减,乔尔·帕克,Aleix屁股,和本杰明Haibe-Kains

维护人员:本杰明Haibe-Kains < benjamin.haibe。实物地租在utoronto.ca >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“genefu”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“genefu”)

PDF	R脚本	genefu介绍(HowTo)
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,软件,可视化
版本	2.18.1
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	survcomp,mclust,limma,biomaRt,iC10,的目标是R (> = 2.10)
进口	北极监测和评估方案,嫁祸于
链接
建议	GeneMeta,breastCancerVDX,breastCancerMAINZ,breastCancerTRANSBIG,breastCancerUPP,breastCancerUNT,breastCancerNKI,rmeta,Biobase,xtable,knitr,脱字符号,生存
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/genefu
取决于我
进口我	consensusOV
建议我	breastCancerMAINZ,breastCancerNKI,breastCancerTRANSBIG,breastCancerUNT,breastCancerUPP,breastCancerVDX
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	genefu_2.18.1.tar.gz
Windows二进制	genefu_2.18.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	genefu_2.18.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefu
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genefu
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/genefu/
包下载报告	下载数据