goseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.goseq

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见goseq

用于RNA-seq和其他长度偏倚数据的基因本体分析器

Bioconductor版本:3.10

检测基因本体和/或其他在RNA-seq数据中过度/不足的用户定义类别

作者:马修·杨

维护者:Matthew Young , Nadia Davidson < Nadia。戴维森在McRi.edu.au >

引文(从R内,输入引用(“goseq”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("goseq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“goseq”)

PDF R脚本 goseq用户指南
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpressionImmunoOncologyRNASeq测序软件转录
版本 1.38.0
在Bioconductor BioC 2.6 (R-2.11)(10年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.11.0),BiasedUrngeneLenDataBase(> = 1.9.2)
进口 mgcv,图形,统计,utils,AnnotationDbiGO.dbBiocGenerics
链接
建议 刨边机org.Hs.eg.dbrtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 rgsepd
进口我 冠军理想的PathwaySplice击杀
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 goseq_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 goseq_1.38.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) goseq_1.38.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goseq
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/goseq
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/goseq/
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