illuminaio

DOI:10.18129 / B9.bioc.illuminaio

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见illuminaio．

解析Illumina Microarray输出文件

Bioconductor版本:3.10

分析Illumina微阵列输出文件的工具，包括IDAT。

作者:Keith Baggerly [aut]， Henrik Bengtsson [aut]， Kasper Daniel Hansen [aut, cre]， Matt Ritchie [aut]， Mike L. Smith [aut]， Tim Triche Jr [ctb]

维护者:Kasper Daniel Hansen

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("illuminaio")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“illuminaio”)

PDF		IDAT加密格式说明
PDF	R脚本	illuminaio简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，微阵列，ProprietaryPlatforms，软件
版本	0.28.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(7年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	base64
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，IlluminaDataTestFiles(> = 1.0.2中),BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio
BugReports	https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio/issues
全靠我	EGSEA123，normalize450K，RnBeads，西瓜
进口我	beadarray，冠军，crlmm，ENmix，methylumi，minfi，芝麻
建议我	limma
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	illuminaio_0.28.0.tar.gz
Windows二进制	illuminaio_0.28.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	illuminaio_0.28.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/illuminaio
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/illuminaio
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/illuminaio/
软件包下载报告	下载数据