imageHTS

DOI:10.18129 / B9.bioc.imageHTS

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见imageHTS．

基于高通量显微镜的屏幕分析

Bioconductor版本:3.10

imagets是一个R包，专门用于分析基于高通量显微镜的屏幕。该软件包提供了一个模块化和可扩展的框架来分割单元格，提取定量的单元格特征，预测单元格类型，并通过web界面浏览屏幕数据。为在分布式环境中运行而设计的imagets提供了对远程数据的标准化访问，并促进了基于显微镜的高通量数据集的传播。

作者:格雷瓜尔·鲍，张宪，迈克尔·布特罗斯，沃尔夫冈·胡贝尔

维护者:Joseph Barry < Joseph。巴里在embl.de >

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("imageHTS")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“imageHTS”)

PDF	R脚本	高通量显微镜屏幕的分析与图像ehts
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，ImmunoOncology，预处理，软件，可视化
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (R-2.12)(9.5年)
许可证	lgpl - 2.1
取决于	R (> = 2.9.0),EBImage(> = 4.3.12),cellHTS2(> = 2.10.0)
进口	工具,Biobase，hwriter、方法、vsn,统计,跑龙套,e1071
链接
建议	BiocStyle，质量
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	imageHTS_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	imageHTS_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	imageHTS_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/imageHTS
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ imageHTS
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/imageHTS/
包下载报告	下载数据