joda

DOI:10.18129 / B9.bioc.joda

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见joda．

利用知识量化基因调控的JODA算法

Bioconductor版本:3.10

包“joda”实现了名为joda的算法的三个步骤。该算法计算基因放松管制得分。对于每个基因，其解除管制得分反映了在两个不同的细胞群中，某种调控因子对该基因的扰动的影响有多强烈。该算法利用了调节器击倒表达式数据以及有关调节器所涉及的信号通路的知识(在一个简单的矩阵模型中正式化)。

作者:Ewa Szczurek

维护者:Ewa Szczurek < Szczurek at molgen.mpg.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("joda")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“joda”)

PDF	R脚本	joda简介
PDF		参考手册

细节

biocViews	GraphAndNetwork，微阵列，NetworkInference，通路，软件，StatisticalMethod
版本	1.34.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(9年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.0)，bgmm，RBGL
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	joda_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	joda_1.34.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	joda_1.34.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/joda
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/joda
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/joda/
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