kimod.

DOI：10.18129 / b9.bioc.kimod.

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅kimod.。

k-tables方法来集成多个OMICS数据

生物导体版本：3.10

此包允许使用混合OMIC数据（转录组，蛋白质组学，微阵列 - 芯片，RNA-SEQ数据），引入以下改进：每个表的距离选项（用于数字和/或分类变量），Bootstrap重采样技术所有方法的残差矩阵，使得能够对折衷的项目变量（基因表达）进行个人，变量和双针方法的投影来执行置信椭圆。Since the main purpose of the package is to use these techniques to omic data analysis, it includes an example data from four different microarray platforms (i.e.,Agilent, Affymetrix HGU 95, Affymetrix HGU 133 and Affymetrix HGU 133plus 2.0) on the NCI-60 cell lines.NCI60_4arrays is a list containing the NCI-60 microarray data with only few hundreds of genes randomly selected in each platform to keep the size of the package small. The data are the same that the package omicade4 used to implement the co-inertia analysis. The references in packages follow the style of the APA-6th norm.

作者：Maria Laura Zingaretti，Johanna Altair Demey-Zambrano，Jose Luis Vicente-Vorlardon，Jhonny Rafael Demey

维护者：M l zingaretti

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！quancenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“kimod”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Kimod”）

PDF.	r script.	Kimod A方法在r中集成多个OMICS数据
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	实验室那基因表达那微阵列那蛋白质组学那软件那可视化
版本	1.14.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（4年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 3.3），方法
进口	簇，图形，BioBase.
链接到
建议
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	Kimod_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件	Kimod_1.14.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	Kimod_1.14.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/kimod.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ kimod
包短网址	https://biocumon.org/packages/kimod/
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