macat

DOI:10.18129 / B9.bioc.macat

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见macat．

微阵列染色体分析工具

Bioconductor版本:3.10

该文库包含了研究差异基因表达和基因染色体定位之间的联系的函数。MACAT的动机是对肿瘤细胞中涉及大染色体区域的常见现象的观察。MACAT是一种用于识别显著差异表达的染色体区域的统计方法的实现。这些功能已经在一个关于急性淋巴细胞白血病(Yeoh et al.Cancer Cell 2002)的公开数据集上进行了测试，该数据集在“stjudem”图书馆中提供。

作者:Benjamin Georgi, Matthias Heinig, Stefan Roepcke, Sebastian Schmeier, Joern Toedling

维护者:Joern Toedling

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("macat")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“macat”)

PDF	R脚本	微阵列染色体分析工具
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，微阵列，软件，可视化
版本	1.60.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 15年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase，注释
进口
链接
建议	hgu95av2.db，stjudem
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	macat_1.60.0.tar.gz
Windows二进制	macat_1.60.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	macat_1.60.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/macat
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ macat
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/macat/
包下载报告	下载数据