此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅mbkmeans。
生物导体版本:3.10
实现用于大型数据集的迷你批次K-均值算法,包括对磁盘数据表示的支持。
作者:Yuwei Ni [AUT,CPH],Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Stephanie Hicks [AUT,CPH],Elizabeth Purdom [AUT,CPH]
维护者:davide risso
引用(从r内,输入引用(“ mbkmeans”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mbkmeans”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Mbkmeans”)
html | R脚本 | mbkmeans vignette |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 聚类,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(1年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | 方法,延迟,,,,RCPP,,,,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,clusterr,,,,基准,,,,矩阵 |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo(> = 0.7.2),Rhdf5lib,,,,beachmat,,,,clusterr |
建议 | beachmat,,,,HDF5Array,,,,Rhdf5lib,,,,生物使用,,,,tenxpbmcdata,,,,评分,,,,延迟的matrixstats,,,,尼特,,,,测试 |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/drisso/mbkmeans/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | mbkmeans_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | mbkmeans_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | mbkmeans_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbkmeans |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/mbkmeans |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/mbkmeans/ |
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