此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见metaseqR.
Bioconductor版本:3.10
为RNA-Seq基因表达数据提供了几个归一化和统计测试包的接口。此外,它创建了几个诊断图,通过结合几个统计测试的结果进行元分析,并以交互式的方式报告结果。
作者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>
维护器:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>
引用(从R中,输入引用(“metaseqR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“metaseqR”)
R脚本 | RNA-Seq数据分析使用多种统计算法与metaseqR | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,ReportWriting,软件,WorkflowStep |
版本 | 1.26.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.14 (R-3.1)(6年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 2.13.0),EDASeq,DESeq,limma,qvalue |
进口 | 刨边机,NOISeq,baySeq,NBPSeq,biomaRt跑龙套,gplots,corrplot,vsn,酿造,rjson,log4r |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,GenomicRanges,rtracklayer,Rsamtools,survcomp,维恩图,knitr,动物园,RUnit,BiocManager,BSgenome,RSQLite |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行,移行细胞癌,RMySQL |
URL | http://www.fleming.gr |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | metaseqR_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | metaseqR_1.26.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | metaseqR_1.26.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/metaseqR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metaseqR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/metaseqR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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