metaseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metaseqR

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见metaseqR

一个R包,用于结合多种统计算法对RNA-Seq数据进行分析和结果报告。

Bioconductor版本:3.10

为RNA-Seq基因表达数据提供了几个归一化和统计测试包的接口。此外,它创建了几个诊断图,通过结合几个统计测试的结果进行元分析,并以交互式的方式报告结果。

作者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>

维护器:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>

引用(从R中,输入引用(“metaseqR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“metaseqR”)

PDF R脚本 RNA-Seq数据分析使用多种统计算法与metaseqR
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionImmunoOncology归一化预处理质量控制RNASeqReportWriting软件WorkflowStep
版本 1.26.0
在Bioconductor公司 BioC 2.14 (R-3.1)(6年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 2.13.0),EDASeqDESeqlimmaqvalue
进口 刨边机NOISeqbaySeqNBPSeqbiomaRt跑龙套,gplotscorrplotvsn酿造rjsonlog4r
链接
建议 BiocGenericsGenomicRangesrtracklayerRsamtoolssurvcomp维恩图knitr动物园RUnitBiocManagerBSgenomeRSQLite
SystemRequirements
增强了 平行,移行细胞癌RMySQL
URL http://www.fleming.gr
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 metaseqR_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 metaseqR_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) metaseqR_1.26.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/metaseqR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metaseqR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/metaseqR/
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