miRSM

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRSM

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见miRSM．

通过整合表达数据和miRNA-靶标结合信息推断miRNA海绵模块

Bioconductor版本:3.10

该包旨在通过整合表达数据和miRNA-target绑定信息来识别miRNA海绵模块。它提供了研究miRNA海绵模块的几个功能，包括流行的推断基因模块(候选miRNA海绵模块)的方法，以及识别miRNA海绵模块的功能，以及对miRNA海绵模块进行模块化分析的几个功能。

作者:张俊鹏[aut, cre]

维护者:张俊鹏

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("miRSM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“miRSM”)

超文本标记语言	R脚本	miRSM:通过整合表达数据和miRNA-target结合信息推断miRNA海绵模块
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细节

biocViews	BiomedicalInformatics，聚类，GeneExpression，GeneRegulation，GeneSetEnrichment，GeneTarget，微阵列，软件
版本	1.4.1
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	WGCNA，flashClust，dynamicTreeCut，联合会，igraph，linkcomm，制程，NMF，biclust，runibic，iBBiG，fabia。，BicARE，isa2，s4vd，BiBitR，rqubic，Biobase，PMA统计数据,dbscan，子空间，mclust，宽边帽，ppclust，miRspongeR，Rcpp跑龙套,SummarizedExperiment，GSEABase，org.Hs.eg.db，MatrixCorrelation，能源
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/zhangjunpeng411/miRSM
BugReports	https://github.com/zhangjunpeng411/miRSM/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	miRSM_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	miRSM_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	miRSM_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRSM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRSM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/miRSM/
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