mlm4omics

DOI:10.18129 / B9.bioc.mlm4omics

这个包是Bioconductor的3.10版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅mlm4omics。

多层次模型多元反应用缺失值

Bioconductor版本:3.10

进行贝叶斯推理回归与多级反应解释变量和缺失值;它使用函数从“斯坦”,软件使用哈密顿实现后抽样MC及其变异Non-U-Turn算法。它实现了后抽样多层次回归模型的回归系数。包有两个主要函数来处理not-missing-at-random失踪的反应和left-censored随机反应完全不是右翼保守势力的迷失了。目的是提供一个类似的格式作为其他R回归函数,但使用“斯坦”模型。

作者:艾琳曾庆红(aut (cre),托马斯Lumley(施)

维护人员:艾琳SL曾庆红<我。曾在auckland.ac.nz >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“mlm4omics”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“mlm4omics”)

HTML	R脚本	引入mlm4omics
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,分类,CopyNumberVariation,ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,回归,软件
版本	1.3.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0),Rcpp(> = 0.12.17)、方法、统计数据
进口	rstan(> = 2.17.3),rstantools(> = 1.5.0),质量,矩阵stats4,ggplot2
链接	StanHeaders(> = 2.17.2),rstan(> = 2.17.3),黑洞(> = 1.66.0-1),Rcpp(> = 0.12.17),RcppEigen(> = 0.3.3.4.0)
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,roxygen2(> = 5.0.0)
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	https://doi.org/10.1101/153049
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	mlm4omics_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	mlm4omics_1.3.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	mlm4omics_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mlm4omics
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mlm4omics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mlm4omics/
包下载报告	下载数据