Motifstack

doi:10.18129/b9.bioc.motifstack

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Motifstack

单个或多个DNA,RNA和氨基酸序列的情节堆叠徽标

生物导体版本:3.10

MotifStack软件包设计用于具有不同相似度分数的多个基线的图形表示。它可以与DNA/RNA序列基序和氨基酸序列基序一起使用。此外,它为用户提供了自定义图形参数(例如字体类型和符号颜色)的灵活性。

作者:Jianhong OU,Michael Brodsky,Scot Wolfe和Lihua Julie Zhu

维护者:jianhong ou

引用(从r内,输入引用(“ Motifstack”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ motifstack”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Motifstack”)

html R脚本 Motifstack Vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,chipseq,,,,芯片,,,,DataImport,,,,微阵列,,,,图案,,,,测序,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.30.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(7。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.15.1),方法,Grimport2, 网格,动机,,,,ADE4,,,,生物弦
进口 XML,,,,,,,,htmlwidgets,grdevices,stats,stats4,图形,utils,GGPLOT2
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,主题,,,,rcolorbrewer,,,,生物使用,,,,尼特,,,,httr,,,,htmltools
系统要求
增强
URL
取决于我 达格洛戈,,,,结肠管制
进口我 atacseqqc,,,,ATSNP,,,,Lowmaca,,,,Motifbreakr,,,,tcgaworkflow
建议我 Chippeakanno,,,,tfutils,,,,Universalmotif
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 motifstack_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 motifstack_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) motifstack_1.30.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifstack
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:套餐/图案
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/motifstack/
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