此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Motifstack。
生物导体版本:3.10
MotifStack软件包设计用于具有不同相似度分数的多个基线的图形表示。它可以与DNA/RNA序列基序和氨基酸序列基序一起使用。此外,它为用户提供了自定义图形参数(例如字体类型和符号颜色)的灵活性。
作者:Jianhong OU,Michael Brodsky,Scot Wolfe和Lihua Julie Zhu
维护者:jianhong ou
引用(从r内,输入引用(“ Motifstack”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ motifstack”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Motifstack”)
html | R脚本 | Motifstack Vignette |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,chipseq,,,,芯片,,,,DataImport,,,,微阵列,,,,图案,,,,测序,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.30.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(7。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.15.1),方法,Grimport2, 网格,动机,,,,ADE4,,,,生物弦 |
进口 | XML,,,,秤,,,,htmlwidgets,grdevices,stats,stats4,图形,utils,GGPLOT2 |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,主题,,,,rcolorbrewer,,,,生物使用,,,,尼特,,,,httr,,,,htmltools |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 达格洛戈,,,,结肠管制 |
进口我 | atacseqqc,,,,ATSNP,,,,Lowmaca,,,,Motifbreakr,,,,tcgaworkflow |
建议我 | Chippeakanno,,,,tfutils,,,,Universalmotif |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | motifstack_1.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | motifstack_1.30.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | motifstack_1.30.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifstack |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:套餐/图案 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/motifstack/ |
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