mzID

DOI:10.18129 / B9.bioc.mzID

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见mzID。

一个用于R的mzIdentML解析器

Bioconductor版本:3.10

使用XML包实现的mzIdentML文件解析器。解析器试图通用并能够处理所有类型的mzIdentML文件，但缺点是没有特定于供应商的解析器那么“漂亮”的输出。如果有任何问题，请联系维护人员，并提供mzIdentML文件，以便快速解决问题。

作者:洛朗·加托[ctb, cre]，托马斯·彼得森[奥特]弗拉季斯拉夫·佩尤克

维护者:Laurent Gatto < Laurent。我想在uclouvain.be b>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mzID")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“mzID”)

PDF	R脚本	使用mzID
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor中	BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法
进口	XML，plyr平行,doParallel，foreach，迭代器，ProtGenerics
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	蛋白质组学
进口我	MSGFgui，MSGFplus，MSnbase，MSnID，Pbase
建议我	mzR，RforProteomics
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	mzID_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	mzID_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	mzID_1.24.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/mzID
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/mzID
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mzID/
软件包下载报告	下载数据