此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见netbenchmark.
Bioconductor版本:3.10
这个包实现了基于基因表达数据的几种基因网络推理算法的基准测试。
作者:Pau Bellot, Catharina Olsen, Patrick Meyer
维护者:Pau Bellot < Pau。在upc.edu bellot >
引用(从R中,输入引用(“netbenchmark”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("netbenchmark")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“netbenchmark”)
超文本标记语言 | R脚本 | Netbenchmark |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | GeneExpression,GraphAndNetwork,微阵列,网络,NetworkInference,软件 |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (R-3.2)(5年) |
许可证 | CC BY-NC-SA 4.0 |
取决于 | grndata(> = 0.99.3) |
进口 | Rcpp(> = 0.11.0)它,minet,GENIE3,c3netPCIT,GeneNet、工具、pracma,矩阵,corpcor,fdrtool |
链接 | Rcpp |
建议 | RUnit,BiocGenerics,knitr,图 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://imatge.upc.edu/netbenchmark/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | netbenchmark_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | netbenchmark_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | netbenchmark_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netbenchmark |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ netbenchmark |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/netbenchmark/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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