netbenchmark

DOI:10.18129 / B9.bioc.netbenchmark

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见netbenchmark

几种基因网络推理方法的基准测试

Bioconductor版本:3.10

这个包实现了基于基因表达数据的几种基因网络推理算法的基准测试。

作者:Pau Bellot, Catharina Olsen, Patrick Meyer

维护者:Pau Bellot < Pau。在upc.edu bellot >

引用(从R中,输入引用(“netbenchmark”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("netbenchmark")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“netbenchmark”)

超文本标记语言 R脚本 Netbenchmark
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews GeneExpressionGraphAndNetwork微阵列网络NetworkInference软件
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (R-3.2)(5年)
许可证 CC BY-NC-SA 4.0
取决于 grndata(> = 0.99.3)
进口 Rcpp(> = 0.11.0)它,minetGENIE3c3netPCIT,GeneNet、工具、pracma矩阵corpcorfdrtool
链接 Rcpp
建议 RUnitBiocGenericsknitr
SystemRequirements
增强了
URL https://imatge.upc.edu/netbenchmark/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 netbenchmark_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 netbenchmark_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) netbenchmark_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netbenchmark
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ netbenchmark
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/netbenchmark/
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