pathprint

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprint

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见pathprint．

用于基因表达阵列分析的路径指纹

Bioconductor版本:3.10

将作为表达式表或GEO引用的基因表达数组转换为“路径指纹”的算法，“路径指纹”是一个离散三元得分向量，表示一组路径中的高(1)、低(-1)或不重要(0)表达。

作者:Gabriel Altschuler, Sokratis Kariotis

维护者:Sokratis Kariotis

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("pathprint")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“pathprint”)

PDF	R脚本	pathprint
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，KEGG，Reactome，软件，转录
版本	1.16.0
在Bioconductor公司	BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.4)
进口	统计,跑龙套
链接
建议	所有，GEOquery，pathprintGEOData，SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	pathprintGEOData
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	pathprint_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	pathprint_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	pathprint_1.16.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprint
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pathprint
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pathprint/
软件包下载报告	下载数据