pcaGoPromoter

DOI:10.18129 / B9.bioc.pcaGoPromoter

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见pcaGoPromoter。

pcaGoPromoter用于分析DNA微阵列数据

Bioconductor版本:3.10

这个包包含的功能，以减轻分析DNA微阵列。它利用主成分分析作为初始的多变量分析，然后利用氧化石墨烯术语的过代表性分析对主成分维度进行功能性解释，并利用primo算法对预测的转录因子结合位点进行过代表性分析进行调控性解释。

作者:Morten Hansen, jorgenolsen

维护人员:Morten Hansen

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("pcaGoPromoter")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“pcaGoPromoter”)

PDF	R脚本	pcaGoPromoter
PDF		参考手册

细节

biocViews	去，GeneExpression，微阵列，软件，可视化
版本	1.30.0
在Bioconductor中	BioC 2.10 (R-2.15)(8年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.14.0)，椭圆，Biostrings
进口	AnnotationDbi
链接
建议	Rgraphviz，GO.db，hgu133plus2.db，mouse4302.db，rat2302.db，hugene10sttranscriptcluster.db，mogene10sttranscriptcluster.db，pcaGoPromoter.Hs.hg19，pcaGoPromoter.Mm.mm9，pcaGoPromoter.Rn.rn4，serumStimulation、并行
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	pcaGoPromoter_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	pcaGoPromoter_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	pcaGoPromoter_1.30.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/pcaGoPromoter
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcaGoPromoter
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pcaGoPromoter/
软件包下载报告	下载数据