此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅pdinfobuilder。
生物导体版本:3.10
构建平台设计信息包。这些由一个包含特征级数据的SQLite数据库组成,例如X,Y位置在芯片和功能ID上。该数据库还包含了功能集级注释数据。该包装的产品由Oligo PKG使用。
作者:塞思·法尔康(Seth Falcon),文斯·凯里(Vince Carey),马特·斯特斯莱斯(Matt Settles),克里斯托夫·德·贝夫(Kristof de Beuf)
维护者:benilton carvalho
引用(从r内,输入引用(“ pdinfobuilder”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pdinfobuilder”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Pdinfobuilder”)
用Pdinfobuilder构建注释包,可与Oligo软件包一起使用 | ||
R脚本 | PDINFO包装构建Affymetrix映射芯片 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.50.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.0(R-2.5)(13年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.2.0),方法,生物酶(> = 2.27.3),rsqlite(> = 1.0.0),affxparser(> = 1.39.4),奥利戈(> = 1.31.5) |
进口 | 生物弦(> = 2.35.12),生物基因(> = 0.13.11),DBI(> = 0.3.1),iranges(> = 2.1.43),寡群(> = 1.29.6),S4VECTORS(> = 0.5.22) |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | maqcexpression4plex |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | pdinfobuilder_1.50.0.tar.gz |
Windows二进制 | PDINFOBUILDER_1.50.0.ZIP |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | pdinfobuilder_1.50.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pdinfobuilder |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/pdinfobuilder |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pdinfobuilder/ |
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