pdinfobuilder

doi:10.18129/b9.bioc.pdinfobuilder

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅pdinfobuilder

平台设计信息包装构建器

生物导体版本:3.10

构建平台设计信息包。这些由一个包含特征级数据的SQLite数据库组成,例如X,Y位置在芯片和功能ID上。该数据库还包含了功能集级注释数据。该包装的产品由Oligo PKG使用。

作者:塞思·法尔康(Seth Falcon),文斯·凯里(Vince Carey),马特·斯特斯莱斯(Matt Settles),克里斯托夫·德·贝夫(Kristof de Beuf)

维护者:benilton carvalho

引用(从r内,输入引用(“ pdinfobuilder”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pdinfobuilder”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Pdinfobuilder”)

PDF 用Pdinfobuilder构建注释包,可与Oligo软件包一起使用
PDF R脚本 PDINFO包装构建Affymetrix映射芯片
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.50.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(13年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.2.0),方法,生物酶(> = 2.27.3),rsqlite(> = 1.0.0),affxparser(> = 1.39.4),奥利戈(> = 1.31.5)
进口 生物弦(> = 2.35.12),生物基因(> = 0.13.11),DBI(> = 0.3.1),iranges(> = 2.1.43),寡群(> = 1.29.6),S4VECTORS(> = 0.5.22)
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 maqcexpression4plex
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pdinfobuilder_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 PDINFOBUILDER_1.50.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) pdinfobuilder_1.50.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pdinfobuilder
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pdinfobuilder
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pdinfobuilder/
软件包下载报告 下载统计

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