此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pepXMLTab.
Bioconductor版本:3.10
基于一个XML包解析pepXML文件。该包试图处理从不同软件生成的pepXML文件。输出将是一个肽谱匹配表格文件。该软件包还提供了基于FDR的电源模块过滤功能。
作者:小菁王
维护者:王小晶<小晶。王在vanderbilt.edu >
引用(从R中,输入引用(“pepXMLTab”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“pepXMLTab”)
R脚本 | 介绍pepXMLTab | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.0.1) |
进口 | XML(> = 3.98 - -1.1) |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | pepXMLTab_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | pepXMLTab_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | pepXMLTab_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pepXMLTab |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pepXMLTab |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/pepXMLTab/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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