pepXMLTab

DOI:10.18129 / B9.bioc.pepXMLTab

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pepXMLTab

解析基于肽FDR的pepXML文件和过滤器。

Bioconductor版本:3.10

基于一个XML包解析pepXML文件。该包试图处理从不同软件生成的pepXML文件。输出将是一个肽谱匹配表格文件。该软件包还提供了基于FDR的电源模块过滤功能。

作者:小菁王

维护者:王小晶<小晶。王在vanderbilt.edu >

引用(从R中,输入引用(“pepXMLTab”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“pepXMLTab”)

PDF R脚本 介绍pepXMLTab
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ImmunoOncologyMassSpectrometry蛋白质组学软件
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.0.1)
进口 XML(> = 3.98 - -1.1)
链接
建议 RUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 pepXMLTab_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 pepXMLTab_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) pepXMLTab_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pepXMLTab
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pepXMLTab
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pepXMLTab/
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