Quantro

doi:10.18129/b9.bioc.quantro

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Quantro

测试何时使用分位数归一化

生物导体版本:3.10

使用原始数据(例如遗传ESET的对象)(例如,expressionset,甲基集)的原始数据对分位数归一化的假设进行数据驱动的测试。还必须提供有关每个样本(例如肿瘤 /正常状态)的小组级别信息,因为测试评估用户定义的组之间的分布是否存在全局差异。

作者:Stephanie Hicks [AUT,CRE],Rafael Irizarry [AUT]

维护者:Stephanie Hicks

引用(从r内,输入引用(“ quantro”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ quantro”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ quantro”)

html R脚本 Quantro用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 微阵列,,,,多重组合,,,,正常化,,,,预处理,,,,测序,,,,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(5。5年)
执照 GPL(> = 3)
要看 R(> = 3.1.3)
进口 生物酶,,,,Minfi,,,,多帕尔,,,,foreach,,,,迭代器,,,,GGPLOT2, 方法,rcolorbrewer
链接
建议 尼特,,,,运行,,,,生物基因,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 QSmooth
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 quantro_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 quantro_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) quantro_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/quantro
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/quantro
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/quantro/
软件包下载报告 下载统计

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