此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅QVALUE。
生物导体版本:3.10
该软件包列出了由许多假设的同时测试产生的p值列表,并估算了其Q值和局部FDR值。当该特定测试称为显着时,测试的Q值测量产生的假阳性(称为假发现率)的比例。鉴于测试的p值,局部FDR测量了零假设的后验概率。各种图会自动生成,从而使一个明智的意义截止。最近已经显示了该软件估计的Q值的保守准确性。该软件可以应用于基因组学,大脑成像,天体物理学和数据挖掘方面的问题。
作者:John D. Storey [Aut,Cre],Andrew J. Bass [AUT],Alan Dabney [AUT],David Robinson [AUT],Gregory Warnes [CTB]
维护者:John D. Storey
引用(从r内,输入引用(“ QVALUE”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ qvalue”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ Qvalue”)
R脚本 | QVALUE软件包 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 多蛋白酶,,,,软件 |
版本 | 2.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15年) |
执照 | LGPL |
要看 | R(> = 2.10) |
进口 | 花键,GGPLOT2, 网格,RESHAPE2 |
链接 | |
建议 | 尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://github.com/jdstorey/qvalue |
取决于我 | Anota,,,,取消分析,,,,嵌合体脑,,,,degseq,,,,drugvsdisease,,,,metaseqr,,,,R3CSEQ,,,,SSPA,,,,Webbioc |
进口我 | 阿纳金,,,,Anota,,,,anota2seq,,,,冠军,,,,clusterProfiler,,,,德芬德,,,,剂量,,,,边缘,,,,Epihet,,,,Erccdashboard,,,,EventPointer,,,,鱼池,,,,ihwpaper,,,,intad,,,,甲基库,,,,msmstests,,,,mwastools,,,,NetResponse,,,,NORMR,,,,关键,,,,过去的,,,,rnasense,,,,rnits,,,,SDAMS,,,,景点,,,,SignaturesEarch,,,,SRAP,,,,subseq,,,,突触,,,,扳机,,,,Webbioc |
建议我 | 生物室,,,,lbe,,,,Maanova,,,,preda,,,,rnainteractmapk,,,,rnbeads,,,,rnbeads,,,,总结,,,,SWFDR |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | qvalue_2.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | qvalue_2.18.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | qvalue_2.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qvalue |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/qvalue |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/qvalue/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |