rfpred

doi:10.18129/b9.bioc.rfpred

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅rfpred

将RFPRED功能预测分数分配给错义变体列表

生物导体版本:3.10

基于众多数据文件,将RFPred分数预先计算在人类外显子组的所有基因组位置上,该软件包将RFPRED分数提供给了由染色体确定的错义变体,位置(HG19版本),指称和替代核苷酸以及Uniprots和Uniprots蛋白质的标识符。请注意,对于使用软件包,必须在Internet上连接用户或下载TabixFile和索引(大约3.3 GO)。

作者:Fabienne Jabot-Hanin,Hugo Varet和Jean-Philippe Jais

维护者:雨果Varet

引用(从r内,输入引用(“ rfpred”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rfpred”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rfpred”)

PDF R脚本 calculatingrfpredscoreswithpackagerfpred
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,分类,,,,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(6。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 rsamtools,,,,基因组机,,,,iranges,,,,Data.Table,方法,并行
进口
链接
建议 生物使用
系统要求
增强
URL http://www.sbim.fr/rfpred
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 RFPRED_1.24.0.TAR.GZ
Windows二进制 RFPRED_1.23.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) RFPRED_1.24.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfpred
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rfpred
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rfpred/
软件包下载报告 下载统计

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