此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅rfpred。
生物导体版本:3.10
基于众多数据文件,将RFPred分数预先计算在人类外显子组的所有基因组位置上,该软件包将RFPRED分数提供给了由染色体确定的错义变体,位置(HG19版本),指称和替代核苷酸以及Uniprots和Uniprots蛋白质的标识符。请注意,对于使用软件包,必须在Internet上连接用户或下载TabixFile和索引(大约3.3 GO)。
作者:Fabienne Jabot-Hanin,Hugo Varet和Jean-Philippe Jais
维护者:雨果Varet
引用(从r内,输入引用(“ rfpred”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rfpred”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rfpred”)
R脚本 | calculatingrfpredscoreswithpackagerfpred | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,分类,,,,软件 |
版本 | 1.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(6。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | rsamtools,,,,基因组机,,,,iranges,,,,Data.Table,方法,并行 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.sbim.fr/rfpred |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | RFPRED_1.24.0.TAR.GZ |
Windows二进制 | RFPRED_1.23.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | RFPRED_1.24.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfpred |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rfpred |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rfpred/ |
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