此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅SRAP。
生物导体版本:3.10
该软件包提供了用于基因表达分析的管道(主要用于RNA-seq数据)。归一化函数对于RNA-seq分析是特异性的,但是所有其他功能(质量控制图,差异表达和可视化以及通过BD-FUNC的功能富集)都将与任何类型的基因表达数据一起使用。
作者:查尔斯·沃登(Charles Warden)
维护者:Charles Warden
引用(从r内,输入引用(“ SRAP”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ srap”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ srap”)
R脚本 | SRAP小插图 | |
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,去,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,统计数据,,,,可视化 |
版本 | 1.26.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(6。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | writexls |
进口 | GPLOTS,,,,请,,,,rocr,,,,QVALUE |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | srap_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | srap_1.26.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | srap_1.26.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/srap |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/srap |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/srap/ |
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